INTOSAI (Medzinárodná organizácia najvyšších kontrolných inštitúcií) je profesijná organizácia zlučujúca najvyššie kontrolné inštitúcie (NKI) krajín, ktoré sú členmi Organizácie Spojených národov alebo jej špecializovaných agentúr. V súčasnosti má 195 riadnych členov (z nich je EDA jediný nadnárodný orgán), päť medzinárodných organizácií s pridruženým členstvom a jedného pridruženého člena. INTOSAI je zaradený medzi podporné organizácie Organizácie Spojených národov.
EDA sa od roku 1980 a ešte pred tým, ako sa stal riadnym členom, aktívne zapája do mnohých činností a pracovných oblastí organizácie INTOSAI, najmä pokiaľ ide o poskytovanie praktických vstupných informácií na účely vypracovania štandardov a usmernení a podporu osvedčených postupov a zabezpečenie kvality. EDA sa zúčastňuje aj na kongresoch organizácie INTOSAI, ktorý sa koná každé tri roky, a pri mnohých príležitostiach nesie zodpovednosť za tému kongresu.
V roku 2004 sa EDA stal riadnym členom INTOSAI po zmene stanov organizácie INTOSAI týkajúcich sa členstva najvyšších kontrolných inštitúcií zastupujúcich nadnárodné organizácie.
V roku 2016, po mnohých rokoch práce v podvýboroch pre finančný audit a účtovníctvo, audit zhody a audit výkonnosti, bol EDA vymenovaný za podpredsedu výboru pre odborné štandardy organizácie INTOSAI.
EDA je tiež členom výboru INTOSAI pre budovanie kapacít a výboru INTOSAI pre zdieľanie poznatkov a zohráva aktívnu úlohu v niekoľkých z týchto pracovných orgánov výborov.
EDA je členom organizácie EUROSAI (Európska organizácia najvyšších kontrolných inštitúcií), európskej regionálnej skupiny INTOSAI. Organizáciu EUROSAI založilo v roku 1990 29 európskych NKI a EDA a v súčasnosti pozostáva z 50 členov. Od svojho vzniku sa EDA intenzívne zapája do rôznych pracovných orgánov EUROSAI.
EDA bol v rokoch 2008 až 2011 externým audítorom EUROSAI a v rokoch 2011 až 2017 členom správnej rady EUROSAI.