El Tribunal fiscaliza anualmente los ingresos y los gastos del presupuesto de la UE y emite una opinión sobre el grado de fiabilidad de las cuentas anuales y sobre el grado de conformidad de las operaciones de ingresos y gastos con la normativa y la reglamentación aplicables.
El gasto total de la UE ascendió a 156 700 millones de euros en 2018. Esto equivale al 1 % de la renta nacional bruta de la UE y representa aproximadamente el 2 % del gasto público total de los Estados miembros. El presupuesto de la UE es aprobado anualmente, en el contexto de marcos financieros de siete años, por el Parlamento Europeo y el Consejo.
La responsabilidad principal de velar por que el presupuesto se gaste de forma adecuada corresponde a la Comisión Europea, junto con las restantes instituciones y órganos de la UE, pero esta responsabilidad también se comparte con los Estados miembros en aproximadamente dos tercios del gasto, correspondiente sobre todo a recursos naturales y a cohesión.
Los auditores del Tribunal verifican muestras de operaciones para facilitar estimaciones de base estadística sobre el grado en que los diferentes ámbitos de ingresos y gastos (grupos de ámbitos políticos) están afectados por errores.