Le rapport annuel d'activités donne une vue d'ensemble des principaux résultats et réalisations de la Cour pendant l'année et décrit les évolutions majeures de l'environnement d'audit et de l'organisation interne de l'institution.
Le rapport de l'ordonnateur délégué comporte des informations sur la gestion des ressources de la Cour des comptes européenne ainsi que sur l'efficience et l'efficacité de ses systèmes de contrôle interne. Il permet de rendre compte de la gestion, tant en interne (au sein de la Cour) que vis-à-vis de l'extérieur (à l'égard des autorités budgétaires): il est envoyé à la Commission, au Parlement européen et au Conseil dans le cadre de la procédure annuelle de décharge du budget.