En sa qualité d’institution supérieure de contrôle (ISC), la Cour se veut à l’avant-garde des évolutions en matière d'audit du secteur public. Elle coopère avec d'autres ISC dans le cadre de l'Organisation internationale des institutions supérieures de contrôle des finances publiques (Intosai) et de son groupe régional européen, l'Eurosai, dans le but d’élaborer des normes professionnelles et des bonnes pratiques. La Cour a été l’une des premières institutions de contrôle à adopter l'examen par les pairs afin de développer et de diffuser les bonnes pratiques au sein de la communauté des ISC.
Le premier examen de la Cour par les pairs réalisé en 2008 a porté sur tous les aspects de ses activités d’audit et de ses opérations administratives. L’examen a été mené par le Bureau du vérificateur général du Canada, conjointement avec les ISC de l’Autriche, de la Norvège et du Portugal.
Le deuxième examen de la Cour par les pairs, mené par l’institution
supérieure de contrôle d'Allemagne, conjointement avec les ISC de France et de
Suède, s'est terminé en 2013. Il portait sur les pratiques de la Cour en
matière d’audit de la performance ainsi que sur le suivi donné aux
recommandations formulées à l’issue de l’examen par les pairs de 2008.