Conform Tratatului privind funcționarea Uniunii Europene, Curtea de Conturi Europeană și instituțiile naționale de audit din statele membre trebuie să practice o cooperare bazată pe încredere și pe respectarea independenței fiecărei instituții. Cooperarea dintre instituțiile supreme de audit din statele membre ale UE și Curte datează încă de la începutul existenței Curții, în 1977, și s-a intensificat de-a lungul anilor.
Curtea colaborează în mod activ cu instituțiile supreme de audit din statele membre ale UE prin intermediul Comitetului de contact.
Comitetul de contact este un grup în cadrul căruia se reunesc anual președinții instituțiilor supreme de audit din statele membre ale UE și președintele Curții de Conturi Europene. Acest comitet asigură un cadru pentru cooperare și pentru schimbul de cunoștințe profesionale și de experiență pe tema auditului fondurilor UE și pe alte teme legate de Uniunea Europeană. Contactul curent dintre instituțiile participante este menținut prin intermediul ofițerilor de legătură desemnați de fiecare instituție. Grupurile de lucru, rețelele și grupurile operative din cadrul Comitetului au rolul de a contribui la elaborarea unor poziții și a unor practici comune.