Todos os anos o TCE audita as receitas e despesas do orçamento da UE e apresenta uma opinião sobre a fiabilidade das contas anuais e a conformidade das operações relativas às receitas e despesas com as regras e regulamentação aplicáveis.
Em 2018, o total das despesas da UE foi de 156,7 mil milhões de euros, o que representa 1% do rendimento nacional bruto da UE e aproximadamente 2% do total das despesas das administrações públicas dos seus Estados-Membros. O orçamento da UE é decidido em cada ano – no contexto de quadros financeiros de sete anos – pelo Parlamento Europeu e pelo Conselho.
Compete em primeiro lugar à Comissão Europeia, juntamente com os outros organismos e instituições da UE, garantir que o orçamento é executado corretamente. Porém, em cerca de dois terços das despesas (essencialmente recursos naturais e coesão), essa responsabilidade é partilhada com os Estados-Membros.
Os auditores do TCE testam amostras de operações de modo a fornecer estimativas baseadas em estatísticas da medida em que as receitas e os diferentes domínios de despesas (grupos de domínios de intervenção) estão afetados por erros.